45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0882 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0882  coenzyme PQQ synthesis D  100 
 
 		 105 aa  210  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2032  coenzyme PQQ synthesis D  80.61 
 
 		 102 aa  163  5.9999999999999996e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3420  coenzyme PQQ synthesis D  80.81 
 
 		 102 aa  161  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0250463  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6303  coenzyme PQQ synthesis protein D  73.74 
 
 		 102 aa  151  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2160  coenzyme PQQ synthesis D  76.53 
 
 		 102 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0791  putative pyrroloquinoline quinone synthesis protein D  55.06 
 
 		 98 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0389  coenzyme PQQ synthesis D  53.93 
 
 		 98 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.886255  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2447  coenzyme PQQ synthesis D  55.06 
 
 		 98 aa  98.6  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0183813 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0080  coenzyme PQQ synthesis D  50.55 
 
 		 91 aa  87.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  49.38 
 
 		 361 aa  80.1  0.000000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3320  coenzyme PQQ synthesis D  44.83 
 
 		 95 aa  76.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  47.44 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1979  coenzyme PQQ synthesis D  41.24 
 
 		 98 aa  71.6  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5989  coenzyme PQQ synthesis D  44.94 
 
 		 99 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1800  coenzyme PQQ synthesis D  43.37 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0396916  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0453  coenzyme PQQ synthesis D  41.38 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0847  coenzyme PQQ synthesis D  44.83 
 
 		 93 aa  67  0.00000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.675494  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.59 
 
 		 366 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.59 
 
 		 372 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5767  coenzyme PQQ synthesis D  40.7 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.986527  normal  0.838308 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.59 
 
 		 362 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2360  coenzyme PQQ synthesis D  42.86 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0690  coenzyme PQQ synthesis D  38.16 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2176  coenzyme PQQ synthesis D  39.02 
 
 		 88 aa  57  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2455  coenzyme PQQ synthesis D  42.19 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1448  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  36.84 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0178012  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1781  coenzyme PQQ synthesis D  34.94 
 
 		 90 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654523  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3916  coenzyme PQQ synthesis D  40.54 
 
 		 98 aa  53.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01589  bifunctional coenzyme PQQ synthesis protein C/D (Pyrroloquinolinequinone biosynthesis protein C/D)  41.67 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4037  coenzyme PQQ synthesis D  29.55 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2491  coenzyme PQQ synthesis D  28.74 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0887783 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2097  coenzyme PQQ synthesis D  28.74 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2469  pyrroloquinoline quinone synthesis D  29.89 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.516173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0291  coenzyme PQQ synthesis D  33.33 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.722803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2834  coenzyme PQQ synthesis D  31.33 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.93819  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1701  coenzyme PQQ synthesis D  30.95 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.596308 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  33.7 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00486118  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5900  coenzyme PQQ synthesis D  32.93 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.512535 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5966  coenzyme PQQ synthesis D  32.93 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.563471  normal  0.0171853 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6167  coenzyme PQQ synthesis D  32.93 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2587  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein D  35.94 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0672438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0308  putative coenzyme PQQ synthesis protein D  32.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0888365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0730  coenzyme PQQ synthesis D  29.89 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240294  normal  0.0491643 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1689  hypothetical protein  31.58 
 
 		 281 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0858  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  29.89 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>