32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0690 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0690  coenzyme PQQ synthesis D  100 
 
 		 100 aa  195  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.397995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3916  coenzyme PQQ synthesis D  54.84 
 
 		 98 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2360  coenzyme PQQ synthesis D  45.05 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0453  coenzyme PQQ synthesis D  46.07 
 
 		 92 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0847  coenzyme PQQ synthesis D  42.86 
 
 		 93 aa  73.9  0.0000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.675494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1979  coenzyme PQQ synthesis D  42.68 
 
 		 98 aa  70.5  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.674068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1818  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.16 
 
 		 366 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0080  coenzyme PQQ synthesis D  49.35 
 
 		 91 aa  70.1  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2154  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  43.18 
 
 		 372 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.113038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0517  coenzyme PQQ biosynthesis protein C  39.39 
 
 		 361 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1770  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqC  42.05 
 
 		 362 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.836859 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5767  coenzyme PQQ synthesis D  43.53 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.986527  normal  0.838308 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1800  coenzyme PQQ synthesis D  43.37 
 
 		 91 aa  66.2  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0396916  normal  0.780369 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5989  coenzyme PQQ synthesis D  41.67 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.894408  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1150  coenzyme PQQ synthesis D  40.7 
 
 		 102 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00942325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0882  coenzyme PQQ synthesis D  38.16 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6303  coenzyme PQQ synthesis protein D  35.9 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3320  coenzyme PQQ synthesis D  33.71 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.263711 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2160  coenzyme PQQ synthesis D  38.16 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2032  coenzyme PQQ synthesis D  34.21 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01589  bifunctional coenzyme PQQ synthesis protein C/D (Pyrroloquinolinequinone biosynthesis protein C/D)  54.17 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3420  coenzyme PQQ synthesis D  35.53 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0250463  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0791  putative pyrroloquinoline quinone synthesis protein D  31.87 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2447  coenzyme PQQ synthesis D  31.87 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0183813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1781  coenzyme PQQ synthesis D  32.26 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.654523  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0389  coenzyme PQQ synthesis D  30.77 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.886255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2491  coenzyme PQQ synthesis D  31.58 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0887783 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1968  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  34.48 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00486118  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2097  coenzyme PQQ synthesis D  30.38 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.274384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41650  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqD  30.49 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2455  coenzyme PQQ synthesis D  35.8 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.143097  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4037  coenzyme PQQ synthesis D  30.59 
 
 		 86 aa  40.4  0.007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.325129  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>