68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5924 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  76.12 
 
 		 67 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  52.24 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  50.75 
 
 		 73 aa  63.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  43.28 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  50 
 
 		 74 aa  60.1  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  48.44 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  48.48 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  45.45 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  43.28 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  44.78 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  42.42 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  44.93 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  45.45 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  40 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  45.45 
 
 		 71 aa  52  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  40.3 
 
 		 72 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  44.12 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  39.39 
 
 		 69 aa  49.7  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  41.79 
 
 		 71 aa  50.1  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  38.81 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  38.81 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  42.19 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  37.31 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  42.65 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  41.79 
 
 		 67 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  35.82 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  37.31 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  35.82 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  37.31 
 
 		 71 aa  47.4  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  41.43 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  45.59 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.31 
 
 		 71 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  38.46 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  39.39 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0826  SlyX family protein  35.82 
 
 		 70 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0859393  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  37.31 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  35.82 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  38.81 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  43.75 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  43.75 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  46.27 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  35.21 
 
 		 73 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  33.78 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  35.71 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  35.21 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  43.75 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2427  SlyX protein  48.48 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0916  SlyX family protein  34.33 
 
 		 70 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000886286  normal  0.0392452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>