30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1564 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  100 
 
 		 74 aa  148  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  63.38 
 
 		 71 aa  90.5  6e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  63.38 
 
 		 71 aa  90.5  6e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  57.53 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  62.5 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  58.46 
 
 		 78 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  53.73 
 
 		 63 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  57.81 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  56.25 
 
 		 73 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  50 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  53.03 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  58.46 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  51.47 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  40.85 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  43.94 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  53.85 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  38.57 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  40.91 
 
 		 71 aa  50.1  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  38.57 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  40.28 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  40.85 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  42.03 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  42.19 
 
 		 71 aa  44.7  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  36.92 
 
 		 65 aa  43.9  0.0008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  42.03 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  36.36 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  33.77 
 
 		 77 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  35.94 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>