20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1381 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  100 
 
 		 65 aa  130  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  33.85 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  30.77 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  29.23 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  35.82 
 
 		 69 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  32.31 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  30.65 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  36.92 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  32.84 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  34.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1949  hypothetical protein  33.82 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  30.77 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  33.33 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  29.85 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  30.16 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  38.57 
 
 		 67 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>