30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1190 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  100 
 
 
69 aa  137  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  43.94 
 
 
75 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  43.48 
 
 
73 aa  56.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  42.86 
 
 
68 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  40.58 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  31.82 
 
 
71 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  34.85 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  37.1 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  31.82 
 
 
71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  33.85 
 
 
71 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  39.39 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  34.33 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  30.77 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  40 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  34.33 
 
 
69 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  31.34 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  32.84 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  35.94 
 
 
64 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  36.99 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  30 
 
 
82 aa  42  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  25.35 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  25.35 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0826  SlyX family protein  31.43 
 
 
70 aa  40.8  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0859393  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  30.77 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  35.29 
 
 
67 aa  40.8  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  34.33 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  37.5 
 
 
72 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  37.5 
 
 
72 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.549919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>