16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0502 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  100 
 
 		 64 aa  131  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0944  SlyX protein, putative  47.69 
 
 		 70 aa  71.6  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  50.82 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  55 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  55 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3950  hypothetical protein  58.33 
 
 		 66 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.399378  normal  0.0602392 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  43.75 
 
 		 71 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1926  hypothetical protein  50 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107906  normal  0.0270065 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  40.98 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  37.88 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  37.5 
 
 		 71 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  42.62 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  42.19 
 
 		 77 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  35.94 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  39.34 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  42.62 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>