19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2956 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  138  3e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  50.82 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0944  SlyX protein, putative  42.86 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  45 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  45 
 
 		 66 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  45.31 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  45.16 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3950  hypothetical protein  42.62 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.399378  normal  0.0602392 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1926  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107906  normal  0.0270065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  40.98 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  39.34 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1418  hypothetical protein  38.46 
 
 		 93 aa  42  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  37.7 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  39.34 
 
 		 68 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  42.62 
 
 		 67 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  36.92 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  37.88 
 
 		 72 aa  40.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  31.88 
 
 		 63 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>