12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3415 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  136  7.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  73.53 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  75.36 
 
 		 69 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  73.91 
 
 		 69 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  57.58 
 
 		 68 aa  70.9  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  57.58 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  57.14 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  36.23 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  38.24 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  36.51 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  32.81 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>