25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4354 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  100 
 
 		 69 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  94.2 
 
 		 69 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  73.91 
 
 		 69 aa  103  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  69.12 
 
 		 74 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  53.97 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  53.97 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  53.97 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  48.44 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  41.18 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  38.46 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  38.57 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  36.11 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  35.29 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  35.71 
 
 		 69 aa  42  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  41.79 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  34.92 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  36.92 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  36.99 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  36.99 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  35.29 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  35.29 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  38.57 
 
 		 68 aa  40.4  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  30.77 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  33.33 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  33.33 
 
 		 72 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>