16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3552 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  100 
 
 		 66 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3950  hypothetical protein  92.42 
 
 		 66 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.399378  normal  0.0602392 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0944  SlyX protein, putative  55.38 
 
 		 70 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  55 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1926  hypothetical protein  56.92 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107906  normal  0.0270065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  45 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  34.85 
 
 		 71 aa  43.9  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  37.5 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  36.36 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  36.36 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1418  hypothetical protein  38.03 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330829 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  33.33 
 
 		 65 aa  41.2  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  38.46 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  39.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>