17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3950 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3950  hypothetical protein  100 
 
 		 66 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.399378  normal  0.0602392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  92.42 
 
 		 66 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  92.42 
 
 		 66 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0944  SlyX protein, putative  56.92 
 
 		 70 aa  72  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.729298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  58.33 
 
 		 64 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1926  hypothetical protein  55.38 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.107906  normal  0.0270065 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  48.33 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  36.36 
 
 		 71 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.88 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  35.94 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  38.1 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1418  hypothetical protein  40.32 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330829 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  38.46 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  32.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  39.68 
 
 		 69 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3415  hypothetical protein  35.38 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.828115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  33.33 
 
 		 65 aa  40  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>