61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_5298 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  100 
 
 		 69 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  78.26 
 
 		 69 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  52.38 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  54.69 
 
 		 70 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  47.62 
 
 		 71 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  51.47 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  47.69 
 
 		 71 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  46.27 
 
 		 72 aa  60.8  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  46.27 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  45.45 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  46.27 
 
 		 72 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  43.08 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  43.75 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  43.08 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  46.03 
 
 		 85 aa  57  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  43.94 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  43.94 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  42.42 
 
 		 67 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  41.79 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  47.62 
 
 		 70 aa  52.8  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  45.59 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  44.12 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  44.29 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  33.33 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5532  SlyX family protein  51.56 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.438123  normal  0.0277582 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  42.42 
 
 		 71 aa  47.8  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  41.54 
 
 		 68 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0894  SlyX family protein  40.91 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.374074 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  38.24 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3604  hypothetical protein  43.94 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  42.42 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  38.57 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  42.03 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  32.35 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1190  SlyX family protein  40 
 
 		 69 aa  45.4  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  29.58 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  36.92 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  39.39 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  39.71 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  37.88 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  31.25 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  36.76 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  31.82 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  37.14 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  38.81 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  32.81 
 
 		 72 aa  42  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  35.38 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  42.62 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.920661  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  38.03 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3235  SlyX protein  38.46 
 
 		 66 aa  40.8  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  34.33 
 
 		 73 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>