75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1262 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  134  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  72.06 
 
 		 68 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  66.67 
 
 		 71 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  61.76 
 
 		 68 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  63.24 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  61.76 
 
 		 68 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  61.76 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  58.82 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  63.77 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  62.32 
 
 		 69 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  60.29 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  40.3 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  47.06 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  40.3 
 
 		 70 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  43.94 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  35.82 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  39.71 
 
 		 71 aa  50.8  0.000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  36.23 
 
 		 69 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  35.29 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  40.58 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1314  hypothetical protein  44.12 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00260587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  35.82 
 
 		 72 aa  47.4  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  38.89 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  35.82 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  35.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  38.46 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  35.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0435  slyX protein  41.79 
 
 		 87 aa  47  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  40 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1006  hypothetical protein  42.65 
 
 		 85 aa  45.8  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.542379  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  43.28 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1068  hypothetical protein  42.65 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.164446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  39.68 
 
 		 70 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  41.18 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  39.68 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1341  SlyX  35.82 
 
 		 71 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  38.24 
 
 		 72 aa  44.3  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  41.79 
 
 		 72 aa  43.5  0.0008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  34.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  35.82 
 
 		 67 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  41.79 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  41.79 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  41.79 
 
 		 72 aa  42.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3475  SlyX family protein  29.41 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000257049  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0887  SlyX family protein  29.41 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0826  SlyX family protein  35.29 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0859393  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3598  SlyX family protein  29.41 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000200097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3400  SlyX family protein  29.41 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000887806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  41.27 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  35.71 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2911  SlyX  29.85 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680162  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  37.88 
 
 		 67 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4354  hypothetical protein  41.79 
 
 		 69 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00524601 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  33.33 
 
 		 73 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  41.27 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3036  SlyX family protein  32.81 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3012  SlyX family protein  31.25 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000625856  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4024  hypothetical protein  39.68 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.79125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  34.21 
 
 		 73 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0966  SlyX family protein  34.38 
 
 		 70 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000107079  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>