29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1260 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  100 
 
 
70 aa  142  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  37.88 
 
 
75 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  34.29 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  29.41 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  33.85 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  31.88 
 
 
71 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  32.31 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  30.77 
 
 
71 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  36.11 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  38.57 
 
 
73 aa  46.2  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  35.38 
 
 
69 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  41.18 
 
 
70 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  34.67 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  36.99 
 
 
72 aa  44.3  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  31.94 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  40.51 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  33.33 
 
 
72 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  38.03 
 
 
70 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  41.27 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  31.94 
 
 
72 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  40 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  30 
 
 
70 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  30.56 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  37.88 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  36.36 
 
 
82 aa  40.4  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  34.72 
 
 
72 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  34.72 
 
 
72 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  34.72 
 
 
72 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>