77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0838 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  100 
 
 		 70 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0966  SlyX family protein  74.29 
 
 		 70 aa  107  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000107079  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0916  SlyX family protein  71.43 
 
 		 70 aa  104  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000886286  normal  0.0392452 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0826  SlyX family protein  71.43 
 
 		 70 aa  104  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0859393  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0901  SlyX family protein  61.43 
 
 		 70 aa  94  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000221316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0938  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  92.4  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000835677  normal  0.089544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2911  SlyX  60 
 
 		 70 aa  91.7  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680162  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3240  SlyX family protein  64.62 
 
 		 70 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000102276  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3036  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  90.5  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1063  slyX protein  58.57 
 
 		 70 aa  89.7  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0640  SlyX protein  59.7 
 
 		 74 aa  90.1  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000012254  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3012  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000625856  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3598  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000200097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0887  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3400  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000887806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3475  SlyX family protein  60 
 
 		 70 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000257049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  55.88 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  59.7 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  55.07 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  55.07 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  55.07 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  55.07 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  55.07 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  56.52 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  55.88 
 
 		 72 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  45.71 
 
 		 72 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  49.21 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  50.75 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  53.73 
 
 		 72 aa  63.5  0.0000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  49.25 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3765  hypothetical protein  49.25 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000104944  hitchhiker  0.00334297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  44.44 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  44.44 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  45.45 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  43.28 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  39.71 
 
 		 74 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4557  SlyX family protein  56.36 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0104276  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  44.87 
 
 		 70 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  36.23 
 
 		 69 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  43.84 
 
 		 68 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  43.28 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  37.31 
 
 		 68 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  34.38 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  41.79 
 
 		 71 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  34.78 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  41.79 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  38.57 
 
 		 68 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.31 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  32.84 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1260  SlyX family protein  41.18 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  37.14 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  34.25 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  37.31 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  31.88 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  34.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0103  SlyX  34.33 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0435  slyX protein  31.43 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  35.82 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  34.78 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  35.29 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  38.89 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01225  hypothetical protein  34.33 
 
 		 78 aa  41.2  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0533489  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  32.84 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  35.82 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1949  hypothetical protein  38.24 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>