20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1949 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1949  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  165  2e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1418  hypothetical protein  47.83 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330829 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1581  putative SlyX protein  47.83 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000650878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1341  SlyX  39.44 
 
 		 71 aa  48.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0901  SlyX family protein  37.14 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000221316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3036  SlyX family protein  37.14 
 
 		 70 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000430182  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3012  SlyX family protein  37.14 
 
 		 70 aa  43.9  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000625856  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0938  SlyX family protein  37.14 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000835677  normal  0.089544 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1063  slyX protein  33.78 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1381  SlyX family protein  33.82 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.269795  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  34.21 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  36.76 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  34.78 
 
 		 74 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  37.68 
 
 		 72 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  32.89 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  34.29 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2911  SlyX  35.14 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000680162  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  32.88 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0838  SlyX family protein  38.24 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000331079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  35.71 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>