23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1341 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1341  SlyX  100 
 
 		 71 aa  143  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  36.23 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  36.36 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  37.68 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1949  hypothetical protein  39.44 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  39.13 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  37.88 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  38.24 
 
 		 69 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  35.82 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  36.51 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  33.82 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  37.5 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  35.94 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  33.33 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3598  SlyX family protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000200097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3475  SlyX family protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000257049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3400  SlyX family protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000887806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0887  SlyX family protein  34.85 
 
 		 70 aa  41.2  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000143556  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  34.85 
 
 		 72 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>