35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0814 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  100 
 
 		 73 aa  148  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  52.05 
 
 		 73 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  50.68 
 
 		 73 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  41.33 
 
 		 68 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  39.13 
 
 		 68 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  41.43 
 
 		 68 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  41.54 
 
 		 69 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  42.86 
 
 		 69 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  39.19 
 
 		 71 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2122  SlyX family protein  36.99 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  47.83 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  38.24 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0435  slyX protein  38.57 
 
 		 87 aa  45.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  40.91 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  34.29 
 
 		 70 aa  44.7  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  36.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  35.21 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4210  hypothetical protein  36.23 
 
 		 68 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.906618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  31.43 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1341  SlyX  36.51 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1208  hypothetical protein  34.78 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.977122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  34.29 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4022  hypothetical protein  35.21 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3842  hypothetical protein  33.33 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  32.39 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  34.78 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  35.29 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  33.33 
 
 		 71 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0269  hypothetical protein  36.62 
 
 		 72 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3684  hypothetical protein  36.62 
 
 		 72 aa  42  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.260505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3927  hypothetical protein  36.62 
 
 		 72 aa  42  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0208778  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1237  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  35.29 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  34.78 
 
 		 73 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>