18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0288 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  100 
 
 		 77 aa  155  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  37.66 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  44.44 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  45.31 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  47.83 
 
 		 73 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  35.06 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  35.53 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  39.39 
 
 		 67 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  42.19 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  41.27 
 
 		 73 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  42.03 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  33.77 
 
 		 74 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  36.23 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  36.76 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  35.71 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  43.66 
 
 		 73 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  35.8 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>