27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_1134 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  100 
 
 		 63 aa  127  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  81.54 
 
 		 70 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  53.73 
 
 		 74 aa  76.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  52.38 
 
 		 73 aa  71.6  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  49.23 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  49.23 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  51.52 
 
 		 67 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  49.21 
 
 		 85 aa  66.6  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  47.69 
 
 		 74 aa  65.5  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  43.94 
 
 		 78 aa  64.3  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  43.08 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  48.48 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  41.54 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  39.68 
 
 		 71 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  42.86 
 
 		 67 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  41.54 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  39.68 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  34.92 
 
 		 75 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  36.07 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  40.91 
 
 		 67 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  34.85 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  36.76 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  40.91 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  36.36 
 
 		 69 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  39.39 
 
 		 67 aa  40.4  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  31.88 
 
 		 69 aa  40  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  37.88 
 
 		 81 aa  40  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>