16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_1372 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  155  1e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  63.77 
 
 		 72 aa  85.9  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  54.79 
 
 		 74 aa  81.6  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  54.17 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  57.97 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  57.97 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  58.46 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  53.12 
 
 		 85 aa  68.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  57.69 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  48.48 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  43.94 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  39.44 
 
 		 70 aa  55.5  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  42.42 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  34.85 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  38.24 
 
 		 66 aa  43.5  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  31.25 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>