26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2515 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  100 
 
 		 71 aa  142  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  63.38 
 
 		 74 aa  90.5  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  67.65 
 
 		 85 aa  84.3  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  60 
 
 		 74 aa  80.1  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  65.08 
 
 		 73 aa  78.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  57.97 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  56.06 
 
 		 72 aa  71.6  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  49.23 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  60.94 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  48.48 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  44.62 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  44.62 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  39.06 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0554  SlyX  37.18 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  31.88 
 
 		 71 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  39.71 
 
 		 71 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  35.21 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  37.5 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  47.69 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  34.92 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  32.39 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  33.33 
 
 		 69 aa  42  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  30.86 
 
 		 81 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  37.5 
 
 		 67 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>