52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0713 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  100 
 
 		 70 aa  144  3e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  84.62 
 
 		 63 aa  107  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  53.62 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  50 
 
 		 72 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  51.56 
 
 		 73 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  51.52 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  50 
 
 		 85 aa  69.7  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  46.48 
 
 		 74 aa  67.4  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  44.62 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  44.62 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  42.25 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  45.45 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  50.77 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.31 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  41.54 
 
 		 66 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  38.1 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  33.87 
 
 		 71 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  40.62 
 
 		 67 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  33.33 
 
 		 75 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  34.92 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  40 
 
 		 68 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  38.57 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  32.86 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  34.85 
 
 		 69 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  43.94 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  39.39 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.88 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  33.85 
 
 		 68 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  37.88 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  33.85 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  31.43 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  35.82 
 
 		 67 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0435  slyX protein  34.85 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  31.82 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3225  SlyX family protein  38.89 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3034  SlyX family protein  35.94 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.159925 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1262  hypothetical protein  38.46 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0728252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  35.82 
 
 		 67 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3258  SlyX family protein  35.94 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.549919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4548  hypothetical protein  37.88 
 
 		 69 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  34.72 
 
 		 72 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2555  SlyX family protein  34.72 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106736  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  38.24 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  34.38 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1418  hypothetical protein  31.82 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.330829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0383  SlyX family protein  34.72 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.729915  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  34.72 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4007  hypothetical protein  37.14 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  33.33 
 
 		 69 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0916  SlyX family protein  36 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000886286  normal  0.0392452 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0502  SlyX protein, putative  32.81 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.743002  normal  0.373998 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1218  SlyX  35.71 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>