41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2830 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  100 
 
 		 85 aa  170  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  59.42 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  67.65 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  67.65 
 
 		 71 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  62.5 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  52.24 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  53.12 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  49.21 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  50.75 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  43.28 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  51.52 
 
 		 72 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  55.07 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  50 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  44.29 
 
 		 71 aa  53.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  40.3 
 
 		 66 aa  48.9  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  46.88 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3722  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000667442  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3650  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000204325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3651  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196147  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3724  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00636343  normal  0.193548 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3629  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000249796  hitchhiker  0.000764322 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3759  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0169067  normal  0.244895 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0365  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0292296  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03199  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000178698  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3544  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000241633  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3822  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0171365  normal  0.979732 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4657  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000000460894  normal  0.0210084 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03150  hypothetical protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000206998  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  37.31 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0365  SlyX family protein  32.35 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000201825  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3817  hypothetical protein  30.88 
 
 		 72 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000379865  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.31 
 
 		 71 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  36.76 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  34.72 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  32.84 
 
 		 73 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  30.3 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  31.34 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  29.85 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  31.34 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03984  SlyX  30.43 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0425699  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  32.84 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>