29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2678 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_2678  SlyX  100 
 
 		 67 aa  135  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  53.12 
 
 		 74 aa  72.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  52.24 
 
 		 85 aa  70.9  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  57.81 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  51.52 
 
 		 63 aa  70.1  0.000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  52.24 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  50.75 
 
 		 73 aa  67.8  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  48.48 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  50 
 
 		 70 aa  64.3  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  48.48 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  48.48 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  49.25 
 
 		 66 aa  62  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  45.45 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  44.78 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2502  SlyX family protein  35.82 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1717  SlyX family protein  34.33 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000834662 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1436  SlyX family protein  34.33 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.423853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2909  SlyX family protein  42.65 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3117  SlyX family protein  34.33 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.251834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  45.59 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  28.36 
 
 		 70 aa  42.7  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  34.33 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  36.76 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2956  hypothetical protein  40.98 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.479909  normal  0.0513755 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3105  SlyX family protein  33.33 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.343313  normal  0.020248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5298  SlyX family protein  38.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.629144  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  44.78 
 
 		 67 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  31.34 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  35.29 
 
 		 71 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>