26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4054 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4054  SlyX family protein  100 
 
 		 74 aa  149  1e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.397873  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2830  SlyX family protein  59.42 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.159899  normal  0.196867 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1564  SlyX family protein  57.53 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1372  hypothetical protein  54.79 
 
 		 78 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2515  SlyX family protein  60 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3168  SlyX family protein  60 
 
 		 71 aa  80.1  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1419  SlyX  52.7 
 
 		 72 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0062  SlyX family protein  52.11 
 
 		 73 aa  76.3  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.918474 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2678  SlyX  53.12 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.4298  normal  0.0474076 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1134  SlyX family protein  47.69 
 
 		 63 aa  65.5  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.830125  normal  0.0936794 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3859  SlyX family protein  55.56 
 
 		 77 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.579394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5924  hypothetical protein  48.44 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0713  SlyX family protein  46.48 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1351  SlyX  42.67 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0809607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1786  SlyX family protein  44.78 
 
 		 66 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5248  hypothetical protein  52.31 
 
 		 67 aa  50.8  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.687803  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1200  hypothetical protein  41.79 
 
 		 71 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2195  hypothetical protein  39.71 
 
 		 75 aa  47.4  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4080  SlyX  35.82 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.867927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4907  SlyX family protein  37.14 
 
 		 71 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.576724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0017  SlyX  35.94 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.643938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1077  SlyX  34.33 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.120233  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  36.23 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4416  hypothetical protein  36.76 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00499452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4228  SlyX  35.82 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2999  hypothetical protein  32.84 
 
 		 70 aa  40.4  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.208006  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>