19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2982 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2982  SlyX family protein  100 
 
 
73 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.781182 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1356  SlyX protein  56.16 
 
 
73 aa  84.3  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000691265  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0814  SlyX family protein  52.05 
 
 
73 aa  83.6  9e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.198377  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2122  SlyX family protein  42.67 
 
 
75 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1638  hypothetical protein  40.85 
 
 
73 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0303  hypothetical protein  35.71 
 
 
74 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18660  hypothetical protein  37.33 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2193  SlyX family protein  38.24 
 
 
73 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002290  protein SlyX  33.33 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000547395  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0309  hypothetical protein  41.67 
 
 
74 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.197458  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00064  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3985  hypothetical protein  33.82 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.149872  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2763  hypothetical protein  33.33 
 
 
72 aa  41.6  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000693224  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51850  hypothetical protein  36.23 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.120935  hitchhiker  0.00317076 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0110  SlyX  34.29 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127465  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1402  hypothetical protein  35.29 
 
 
68 aa  41.2  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.591267  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0288  SlyX protein, putative  43.66 
 
 
77 aa  40.4  0.007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.976971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2615  hypothetical protein  38.24 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.616252  normal  0.249759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0307  SlyX family protein  36.76 
 
 
72 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.454596  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>