48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3553 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3553  patatin  100 
 
 		 303 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  88.65 
 
 		 298 aa  520  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  72.26 
 
 		 297 aa  429  1e-119  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  73.17 
 
 		 297 aa  425  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  72.82 
 
 		 297 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  70.07 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  69.37 
 
 		 292 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  67.62 
 
 		 288 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  69.01 
 
 		 289 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  68.66 
 
 		 289 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  70.18 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  397  1e-109  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  69.82 
 
 		 288 aa  395  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  40.36 
 
 		 296 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  39.11 
 
 		 279 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  22.12 
 
 		 397 aa  52.8  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  27.91 
 
 		 379 aa  52.8  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  24.58 
 
 		 923 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  23.57 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  19.67 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  19.67 
 
 		 283 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  19.34 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0858  Patatin  25.23 
 
 		 399 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  22.86 
 
 		 283 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2085  patatin  41.1 
 
 		 314 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  22.86 
 
 		 283 aa  46.6  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  22.86 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  24.43 
 
 		 291 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2694  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.57 
 
 		 763 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.93746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1632  Patatin  29.93 
 
 		 305 aa  45.1  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14290  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  25.1 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  34.25 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4609  patatin  25.88 
 
 		 379 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.995151 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4143  patatin  27.31 
 
 		 379 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.517871 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  23.29 
 
 		 283 aa  42.7  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1274  hypothetical protein  23.6 
 
 		 311 aa  42.7  0.008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00136358 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  23.87 
 
 		 284 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  22.14 
 
 		 283 aa  42.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>