30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3420 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  100 
 
 		 297 aa  606  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  98.32 
 
 		 297 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  85.52 
 
 		 297 aa  528  1e-149  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  72.76 
 
 		 298 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  74.04 
 
 		 292 aa  424  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  74.74 
 
 		 292 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  73.85 
 
 		 303 aa  424  1e-117  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  69.72 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  72.14 
 
 		 288 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  72.14 
 
 		 288 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  69.97 
 
 		 289 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  71.58 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  72.14 
 
 		 288 aa  403  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  71.79 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  71.79 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  71.79 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  71.79 
 
 		 288 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  40.29 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  39.86 
 
 		 279 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  25.81 
 
 		 397 aa  50.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  26.58 
 
 		 378 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2977  Patatin  24.46 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.196645  normal  0.833141 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2033  patatin  23.11 
 
 		 923 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0624212  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3040  patatin  27.57 
 
 		 291 aa  44.3  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0931939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>