48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A4424 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  100 
 
 
292 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  97.26 
 
 
292 aa  588  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  87.54 
 
 
288 aa  531  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  83.57 
 
 
288 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  82.58 
 
 
289 aa  489  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  82.87 
 
 
288 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  83.87 
 
 
288 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  82.75 
 
 
289 aa  481  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  83.87 
 
 
288 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  83.87 
 
 
288 aa  481  1e-135  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  83.51 
 
 
288 aa  478  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  83.15 
 
 
288 aa  477  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  75 
 
 
297 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  74.74 
 
 
297 aa  423  1e-117  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  69.42 
 
 
298 aa  411  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  70.07 
 
 
303 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  71.13 
 
 
297 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  41.82 
 
 
296 aa  224  1e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  38.6 
 
 
279 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  23.34 
 
 
283 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  23.34 
 
 
283 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  22.71 
 
 
283 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2716  putative phospholipase  23.03 
 
 
283 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.490446  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  22.71 
 
 
283 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  22.44 
 
 
283 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2593  putative phospholipase  22.71 
 
 
283 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0159021 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2512  hypothetical protein  27.92 
 
 
240 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00693328  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  25.45 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4528  phospholipase, patatin family  23.85 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.430948  normal  0.279256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  22.64 
 
 
283 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0821  phospholipase, patatin family  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5960900000000002e-53 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0815  phospholipase, putative  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0555533  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0745  phospholipase  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0574828  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0652  phospholipase  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0951235  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0653  phospholipase  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000540236  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0709  phospholipase  23.85 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.626659  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0900  phospholipase, patatin family  23.39 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0630  patatin  23.39 
 
 
284 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000302445  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13100  predicted esterase of the alpha-beta hydrolase superfamily  34.07 
 
 
293 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0309972  normal  0.551391 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0803  phospholipase, patatin family  23.39 
 
 
284 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.240564  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0660  patatin  22.94 
 
 
284 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2781  Patatin  25.34 
 
 
306 aa  43.5  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.874776  normal  0.443511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>