29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA0136 on replicon NC_006348
Organism: Burkholderia mallei ATCC 23344



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  100 
 
 
289 aa  589  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  95.85 
 
 
289 aa  568  1e-161  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  87.54 
 
 
288 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  84.04 
 
 
288 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  86.91 
 
 
288 aa  497  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  86.12 
 
 
288 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  86.12 
 
 
288 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  86.91 
 
 
288 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  86.12 
 
 
288 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  86.12 
 
 
288 aa  495  1e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  82.75 
 
 
292 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  82.04 
 
 
292 aa  480  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  70.18 
 
 
298 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  70.77 
 
 
297 aa  408  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  71.58 
 
 
297 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  69.01 
 
 
303 aa  404  1.0000000000000001e-112  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  71.48 
 
 
297 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  41.88 
 
 
296 aa  234  9e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  40.07 
 
 
279 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  20.71 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  20.71 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2763  putative phospholipase  20.71 
 
 
283 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.224384  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  20.39 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>