26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0013 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  599  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  85.52 
 
 		 297 aa  528  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  85.19 
 
 		 297 aa  526  1e-148  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  74.2 
 
 		 298 aa  432  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  72.26 
 
 		 303 aa  428  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  73.48 
 
 		 288 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  69.72 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  72.76 
 
 		 288 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  70.77 
 
 		 292 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  72.4 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  72.4 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  72.4 
 
 		 288 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  71.13 
 
 		 292 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  72.76 
 
 		 288 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  408  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  72.4 
 
 		 288 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  70.77 
 
 		 289 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  40.5 
 
 		 296 aa  225  8e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  41.09 
 
 		 279 aa  166  5e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1075  Patatin  25.45 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>