27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3188 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3188  patatin  100 
 
 		 288 aa  590  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  99.31 
 
 		 288 aa  589  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  97.22 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  97.22 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  97.22 
 
 		 288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  96.88 
 
 		 288 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  93.75 
 
 		 288 aa  554  1e-157  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  84.34 
 
 		 288 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  87.68 
 
 		 289 aa  502  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  86.91 
 
 		 289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  83.57 
 
 		 292 aa  488  1e-137  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  82.52 
 
 		 292 aa  485  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  72.76 
 
 		 297 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  72.14 
 
 		 297 aa  404  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  72.04 
 
 		 297 aa  401  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  69.82 
 
 		 303 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  70.91 
 
 		 298 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  41.64 
 
 		 296 aa  230  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  38.6 
 
 		 279 aa  159  6e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  25.33 
 
 		 379 aa  43.5  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0420  patatin  24.55 
 
 		 397 aa  42.4  0.009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0379208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>