27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3655 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3655  patatin  100 
 
 		 296 aa  608  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  43.77 
 
 		 288 aa  245  6e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  41.97 
 
 		 298 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  42.09 
 
 		 289 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  41.88 
 
 		 289 aa  234  9e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  40.88 
 
 		 303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  41.99 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  41.99 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  41.99 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  41.99 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  41.64 
 
 		 288 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  41.64 
 
 		 288 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  41.61 
 
 		 288 aa  228  9e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  42.18 
 
 		 292 aa  226  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  40.5 
 
 		 297 aa  225  8e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  41.82 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  40.29 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  40.14 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  39.25 
 
 		 279 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2084  Patatin  36.92 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.1896  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2488  Patatin  31.9 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>