32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_2520 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_3133  patatin  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2520  patatin  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3149  patatin  100 
 
 
288 aa  591  1e-168  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.294713 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6484  patatin  97.92 
 
 
288 aa  579  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.8786 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3188  patatin  97.22 
 
 
288 aa  574  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0264466  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3071  patatin  97.22 
 
 
288 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.624704 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3130  patatin  94.1 
 
 
288 aa  558  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0897531  hitchhiker  0.00440528 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0028  patatin  85.25 
 
 
288 aa  501  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0122  patatin-like phospholipase  87.32 
 
 
289 aa  500  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2814  patatin-like phospholipase  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.291409  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2268  patatin-like phospholipase  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.145338  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0340  patatin-like phospholipase family protein  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.456756  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0142  patatin  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0136  patatin-like phospholipase  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0150  patatin family phospholipase  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.622128  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2345  patatin-like phospholipase  86.12 
 
 
289 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.364916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4424  putative patatin-like phospholipase protein  83.87 
 
 
292 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25006  normal  0.316813 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0302  Patatin  82.8 
 
 
292 aa  478  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0013  hypothetical protein  72.4 
 
 
297 aa  409  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.822335  normal  0.137415 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3434  patatin  71.64 
 
 
298 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3420  Patatin  71.79 
 
 
297 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0411725  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3553  patatin  69.82 
 
 
303 aa  396  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3743  Patatin  71.68 
 
 
297 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3655  patatin  41.99 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5146  patatin  39.71 
 
 
279 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.31564  normal  0.0153035 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1044  alpha-beta hydrolase family esterase  21.72 
 
 
283 aa  49.7  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0733835  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1851  patatin  20.39 
 
 
283 aa  45.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.255911  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2711  putative phospholipase  19.67 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000208359 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2473  patatin-like phospholipase  19.67 
 
 
283 aa  44.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000274868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0966  patatin  24.89 
 
 
379 aa  43.9  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.612585  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2438  serine protease  19.34 
 
 
283 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00741052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2446  patatin  19.68 
 
 
283 aa  42.7  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0616415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>