57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1257 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  351  2.9999999999999997e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  91.41 
 
 		 305 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  91.08 
 
 		 177 aa  290  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  90.45 
 
 		 177 aa  286  1e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  84.05 
 
 		 181 aa  280  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  88.24 
 
 		 281 aa  280  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  87.58 
 
 		 185 aa  278  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  82.82 
 
 		 179 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  84.18 
 
 		 181 aa  275  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  82.21 
 
 		 181 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  80.98 
 
 		 185 aa  271  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  84.18 
 
 		 181 aa  271  5.000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  83.23 
 
 		 181 aa  270  7e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  76.74 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  76.74 
 
 		 174 aa  266  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  86.75 
 
 		 152 aa  264  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  79.63 
 
 		 185 aa  261  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  73.86 
 
 		 177 aa  259  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  79.11 
 
 		 177 aa  256  1e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  76.43 
 
 		 181 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  64.79 
 
 		 175 aa  188  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  141  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  42.05 
 
 		 173 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  45.27 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  41.51 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  44.97 
 
 		 162 aa  125  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  41.14 
 
 		 173 aa  125  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  42.95 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  41.83 
 
 		 161 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  39.63 
 
 		 167 aa  123  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  41.33 
 
 		 159 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  44.3 
 
 		 160 aa  121  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  41.61 
 
 		 160 aa  120  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  43.71 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.27 
 
 		 168 aa  119  3e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  40.69 
 
 		 167 aa  117  7e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  41.18 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  42.28 
 
 		 172 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  42.14 
 
 		 165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  39.29 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  36.78 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  36.78 
 
 		 173 aa  115  3e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  41.22 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  41.22 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  46.5 
 
 		 162 aa  114  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  40.91 
 
 		 173 aa  114  6e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  39.74 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  39.6 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  43.75 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  39.6 
 
 		 159 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  41.56 
 
 		 171 aa  111  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  39.66 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  39.52 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  40.96 
 
 		 169 aa  107  9.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  33.76 
 
 		 171 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  36.84 
 
 		 172 aa  103  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  40.38 
 
 		 106 aa  85.1  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>