57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4169 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  74.23 
 
 		 181 aa  256  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  77.22 
 
 		 181 aa  255  2e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  74.23 
 
 		 305 aa  255  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  76.58 
 
 		 181 aa  253  7e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  75.31 
 
 		 179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  76.43 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  76.92 
 
 		 177 aa  253  1.0000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  75.64 
 
 		 177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  73.46 
 
 		 185 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  70.41 
 
 		 174 aa  251  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  70.41 
 
 		 174 aa  251  5.000000000000001e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  75.32 
 
 		 181 aa  251  6e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  70.55 
 
 		 181 aa  244  6e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  76.82 
 
 		 152 aa  243  9.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  72.67 
 
 		 185 aa  243  9.999999999999999e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  70.12 
 
 		 185 aa  238  2.9999999999999997e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  70.7 
 
 		 177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  64.09 
 
 		 177 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  75.17 
 
 		 281 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  54.91 
 
 		 175 aa  184  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  40.78 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  44.67 
 
 		 173 aa  131  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  44.3 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  44.67 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  40.99 
 
 		 173 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  44.81 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  40.67 
 
 		 160 aa  120  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  40.76 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  40 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  39.33 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  42.38 
 
 		 172 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  42.95 
 
 		 162 aa  117  9.999999999999999e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.13 
 
 		 168 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  40.27 
 
 		 161 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  40.94 
 
 		 154 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  42.36 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  39.47 
 
 		 160 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  38.67 
 
 		 159 aa  114  8.999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  40.12 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  40.28 
 
 		 167 aa  112  3e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  39.77 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  39.33 
 
 		 173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  35.26 
 
 		 181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  38.93 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  37.8 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  40.26 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  38.51 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  39.86 
 
 		 166 aa  108  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  37.58 
 
 		 173 aa  108  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  40.67 
 
 		 173 aa  105  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  42.36 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  38 
 
 		 169 aa  104  6e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  39.42 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>