57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2657 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  100 
 
 
185 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  92.02 
 
 
185 aa  303  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  86.34 
 
 
181 aa  284  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  90.67 
 
 
152 aa  280  1e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  82.93 
 
 
181 aa  279  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  82.82 
 
 
179 aa  278  3e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  84.91 
 
 
181 aa  272  3e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  81.99 
 
 
181 aa  266  1e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  77.58 
 
 
305 aa  260  6e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  80.38 
 
 
177 aa  259  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  79.62 
 
 
177 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  69.71 
 
 
177 aa  255  3e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  78.98 
 
 
177 aa  252  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  74.4 
 
 
281 aa  250  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  73.94 
 
 
181 aa  250  9.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  70.27 
 
 
185 aa  250  1e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  71.76 
 
 
174 aa  245  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  71.76 
 
 
174 aa  245  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  73.08 
 
 
181 aa  239  1e-62  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  73.72 
 
 
177 aa  235  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  54.88 
 
 
175 aa  175  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  46.94 
 
 
176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  44 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  43.54 
 
 
173 aa  125  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  43.71 
 
 
160 aa  122  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  41.21 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  42.28 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  41.61 
 
 
173 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  41.94 
 
 
161 aa  117  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  42.95 
 
 
169 aa  117  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  40 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  37.64 
 
 
181 aa  115  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  111  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  37.65 
 
 
167 aa  111  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  41.5 
 
 
160 aa  111  7.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  38.95 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  38.95 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  37.87 
 
 
172 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  40.27 
 
 
159 aa  108  4.0000000000000004e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  43.62 
 
 
171 aa  107  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  40.28 
 
 
167 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  39.6 
 
 
167 aa  107  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  39.75 
 
 
162 aa  106  2e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  40.85 
 
 
179 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  39.29 
 
 
169 aa  105  5e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  40.82 
 
 
162 aa  105  5e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  37.58 
 
 
154 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  38.25 
 
 
173 aa  104  8e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  40.79 
 
 
172 aa  104  9e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  40.27 
 
 
173 aa  103  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  39.73 
 
 
166 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  39.73 
 
 
166 aa  103  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  36 
 
 
172 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  38.19 
 
 
159 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  38.46 
 
 
171 aa  97.8  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  34.69 
 
 
171 aa  94.4  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  73.2  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>