57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3371 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  85.23 
 
 		 162 aa  269  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  60.62 
 
 		 172 aa  207  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  62.5 
 
 		 167 aa  202  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  62.42 
 
 		 176 aa  199  9.999999999999999e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  62.67 
 
 		 172 aa  198  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  60.81 
 
 		 168 aa  197  7.999999999999999e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  62 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  62 
 
 		 173 aa  196  1.0000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  61.84 
 
 		 173 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  60.81 
 
 		 169 aa  192  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  53.33 
 
 		 165 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  58.86 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  60.67 
 
 		 173 aa  191  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  57.43 
 
 		 173 aa  190  7e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  63.7 
 
 		 173 aa  189  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  54.84 
 
 		 172 aa  188  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  55.77 
 
 		 171 aa  187  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  60.93 
 
 		 159 aa  187  7e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  57.24 
 
 		 154 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  59.73 
 
 		 167 aa  184  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  53.46 
 
 		 167 aa  180  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  58.28 
 
 		 173 aa  180  9.000000000000001e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  60.67 
 
 		 171 aa  179  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  55.63 
 
 		 171 aa  178  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  54 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  60.14 
 
 		 169 aa  177  4e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  55.63 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  51.92 
 
 		 181 aa  169  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  54.67 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  54.49 
 
 		 162 aa  167  4e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  52.26 
 
 		 179 aa  167  5e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  55.48 
 
 		 159 aa  167  8e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  52.29 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  64.42 
 
 		 106 aa  151  5e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  45.18 
 
 		 175 aa  127  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  41.18 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  41.83 
 
 		 305 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  41.33 
 
 		 281 aa  115  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  41.22 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  43.36 
 
 		 179 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  39.07 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  41.18 
 
 		 177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  38.82 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  39.86 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  40.41 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  39.73 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  39.73 
 
 		 174 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  39.04 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  37.67 
 
 		 181 aa  104  7e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  103  7e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  39.73 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  39.73 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  36.99 
 
 		 181 aa  101  4e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  37.76 
 
 		 181 aa  96.7  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>