57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0848 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  65.38 
 
 		 173 aa  152  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  64.42 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  64.42 
 
 		 166 aa  151  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  62.86 
 
 		 162 aa  148  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  65.09 
 
 		 173 aa  148  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  68.27 
 
 		 173 aa  147  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  63.46 
 
 		 172 aa  147  7e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  65.38 
 
 		 167 aa  146  8e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  63.81 
 
 		 172 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  65.71 
 
 		 160 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  60.95 
 
 		 167 aa  144  5e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  65.71 
 
 		 165 aa  144  5e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  61.54 
 
 		 173 aa  144  5e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  64.42 
 
 		 169 aa  143  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  63.46 
 
 		 168 aa  140  4e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  66.67 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  66.67 
 
 		 173 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  61.9 
 
 		 161 aa  138  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  58.49 
 
 		 176 aa  137  3.9999999999999997e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  59.43 
 
 		 173 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  56.6 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  60 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  60.58 
 
 		 171 aa  134  3.0000000000000003e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  56.6 
 
 		 173 aa  135  3.0000000000000003e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  55.24 
 
 		 154 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  57.14 
 
 		 159 aa  133  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  59.8 
 
 		 159 aa  128  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  56.19 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  56.86 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  52.88 
 
 		 171 aa  126  9.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  54.81 
 
 		 181 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  57.14 
 
 		 169 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  53.33 
 
 		 179 aa  124  6e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  50.94 
 
 		 167 aa  123  8.000000000000001e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  50.98 
 
 		 159 aa  110  7.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  40.38 
 
 		 177 aa  84.7  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  38.46 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  43.43 
 
 		 179 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  40.95 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  39.05 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  40.38 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  40.38 
 
 		 174 aa  79.7  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  38.46 
 
 		 177 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  38.46 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  39.6 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  40.2 
 
 		 305 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  40.2 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  39.42 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  39.42 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  35.58 
 
 		 185 aa  77  0.00000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  39.39 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  38.46 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  38.38 
 
 		 181 aa  74.3  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  38.46 
 
 		 152 aa  73.9  0.0000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  38.46 
 
 		 185 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>