57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_3012 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  349  1e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  75 
 
 
173 aa  268  4e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  73.26 
 
 
173 aa  266  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  72.19 
 
 
173 aa  254  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  72.19 
 
 
173 aa  254  5e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  74.23 
 
 
176 aa  253  1.0000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  69.59 
 
 
171 aa  236  2e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  67.44 
 
 
173 aa  233  1.0000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  66.04 
 
 
169 aa  224  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  68.59 
 
 
167 aa  224  7e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  69.54 
 
 
154 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  65.12 
 
 
173 aa  223  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  70 
 
 
168 aa  222  2e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  63.37 
 
 
172 aa  219  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  66.04 
 
 
160 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  64.33 
 
 
172 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  68.21 
 
 
173 aa  218  5e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  69.03 
 
 
161 aa  215  2e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  62.75 
 
 
165 aa  211  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  66.45 
 
 
167 aa  208  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  65.16 
 
 
167 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  62.99 
 
 
162 aa  201  4e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  61.54 
 
 
169 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  62.91 
 
 
159 aa  200  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  64 
 
 
171 aa  197  5e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  59.48 
 
 
172 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  58.43 
 
 
181 aa  195  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  60.4 
 
 
171 aa  193  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  60.67 
 
 
166 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  60.67 
 
 
166 aa  191  6e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  58 
 
 
160 aa  187  8e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  57.05 
 
 
159 aa  182  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  62.42 
 
 
162 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  54.9 
 
 
159 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  53.33 
 
 
179 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  68.27 
 
 
106 aa  147  6e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  41.92 
 
 
181 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  44.67 
 
 
181 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  41.14 
 
 
177 aa  124  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  41.61 
 
 
181 aa  124  1e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  42.28 
 
 
152 aa  121  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  45.14 
 
 
179 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  41.4 
 
 
181 aa  121  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  40.79 
 
 
177 aa  121  5e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  40.74 
 
 
185 aa  121  5e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  42.86 
 
 
305 aa  121  6e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  44.06 
 
 
175 aa  120  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  40.27 
 
 
281 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  39.75 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  40.94 
 
 
177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  42.28 
 
 
185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  39.49 
 
 
181 aa  117  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  38.93 
 
 
185 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  38.71 
 
 
177 aa  112  3e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  37.5 
 
 
174 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  35.93 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>