57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1606 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  100 
 
 
171 aa  345  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  69.59 
 
 
173 aa  252  2.0000000000000002e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  66.08 
 
 
173 aa  239  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  66.27 
 
 
173 aa  231  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  66.27 
 
 
173 aa  231  5e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  72 
 
 
173 aa  225  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  68.21 
 
 
154 aa  218  5e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  65.43 
 
 
173 aa  217  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  66.23 
 
 
161 aa  214  5e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  68 
 
 
176 aa  212  1.9999999999999998e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  62.57 
 
 
169 aa  211  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  63.82 
 
 
167 aa  209  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  61.31 
 
 
173 aa  209  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  64.47 
 
 
172 aa  206  1e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  62.5 
 
 
168 aa  204  4e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  63.06 
 
 
160 aa  204  4e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  63.58 
 
 
165 aa  201  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  63.27 
 
 
167 aa  199  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  58.72 
 
 
172 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  59.17 
 
 
169 aa  197  3.9999999999999996e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  59.54 
 
 
173 aa  197  6e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  63.76 
 
 
162 aa  196  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  62.75 
 
 
159 aa  195  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  64.67 
 
 
181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  64.24 
 
 
167 aa  194  5.000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  56.71 
 
 
172 aa  192  3e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  61.29 
 
 
159 aa  191  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  60.67 
 
 
166 aa  187  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  61.07 
 
 
160 aa  188  4e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  60.67 
 
 
166 aa  187  4e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  60.26 
 
 
171 aa  187  9e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  56.29 
 
 
171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  65.1 
 
 
162 aa  181  3e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  57.72 
 
 
159 aa  174  7e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  55.03 
 
 
179 aa  169  2e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  60.58 
 
 
106 aa  134  5e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  47.55 
 
 
175 aa  122  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  42.95 
 
 
181 aa  120  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  41.56 
 
 
177 aa  120  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  44.44 
 
 
305 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  42.95 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  41.61 
 
 
181 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  40.72 
 
 
185 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  42.28 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  41.61 
 
 
281 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  42.28 
 
 
152 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  41.18 
 
 
177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  42.33 
 
 
179 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  43.62 
 
 
185 aa  115  3e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  42.36 
 
 
181 aa  114  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  40.97 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  40.27 
 
 
177 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  40.27 
 
 
174 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  40.27 
 
 
174 aa  108  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  38.26 
 
 
177 aa  108  3e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  37.91 
 
 
181 aa  107  6e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  37.58 
 
 
185 aa  107  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>