57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3181 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  329  8e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  85.23 
 
 		 166 aa  269  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  85.23 
 
 		 166 aa  269  1e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  64.43 
 
 		 172 aa  214  2.9999999999999998e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  66.44 
 
 		 172 aa  211  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  63.8 
 
 		 167 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  64.24 
 
 		 173 aa  205  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  60 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  65.56 
 
 		 176 aa  202  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  62.91 
 
 		 154 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  63.09 
 
 		 169 aa  201  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  62.99 
 
 		 173 aa  201  3e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  62.67 
 
 		 159 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  61.74 
 
 		 168 aa  198  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  64.43 
 
 		 173 aa  197  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  64.43 
 
 		 173 aa  197  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  59.48 
 
 		 165 aa  196  1.0000000000000001e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  62.42 
 
 		 160 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  62.34 
 
 		 169 aa  194  3e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  61.33 
 
 		 171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  64 
 
 		 173 aa  194  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  60.81 
 
 		 167 aa  193  1e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  62.67 
 
 		 173 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  58.23 
 
 		 167 aa  191  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  58.39 
 
 		 172 aa  191  4e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  57.79 
 
 		 173 aa  190  7e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  63.76 
 
 		 171 aa  186  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  59.18 
 
 		 160 aa  186  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  57.05 
 
 		 171 aa  185  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  58.67 
 
 		 161 aa  184  4e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  57.82 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  61.33 
 
 		 162 aa  180  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  56.76 
 
 		 179 aa  177  4.999999999999999e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  56.38 
 
 		 181 aa  175  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  54.42 
 
 		 159 aa  159  2e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  62.86 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  47.62 
 
 		 305 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  46.26 
 
 		 177 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  44.97 
 
 		 177 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  48.95 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  45.14 
 
 		 281 aa  121  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  45.14 
 
 		 179 aa  118  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  42.95 
 
 		 181 aa  117  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  44.22 
 
 		 177 aa  117  9e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  42.86 
 
 		 177 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  43.06 
 
 		 185 aa  115  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  42.86 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  41.5 
 
 		 181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  42.18 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  42.18 
 
 		 174 aa  110  6e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  40.82 
 
 		 181 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  42.18 
 
 		 185 aa  110  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  41.5 
 
 		 177 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  42.86 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  42.36 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  41.67 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  40.82 
 
 		 185 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>