57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_0689 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  362  2e-99  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  92.68 
 
 
181 aa  309  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  89.22 
 
 
181 aa  300  8.000000000000001e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  85.19 
 
 
181 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  85.71 
 
 
179 aa  278  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  89.47 
 
 
152 aa  276  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  84.18 
 
 
305 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  83.85 
 
 
185 aa  275  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  85.26 
 
 
177 aa  272  2.0000000000000002e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  84.18 
 
 
177 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  81.01 
 
 
181 aa  265  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  82.69 
 
 
177 aa  265  2e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  81.99 
 
 
185 aa  265  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  74.59 
 
 
185 aa  264  5e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  83.33 
 
 
281 aa  257  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  78.06 
 
 
181 aa  255  3e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  72.83 
 
 
174 aa  254  4e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  72.83 
 
 
174 aa  254  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  77.27 
 
 
177 aa  246  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  69.49 
 
 
177 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  61.74 
 
 
175 aa  183  1.0000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  42.94 
 
 
176 aa  141  6e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  40.72 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  41.92 
 
 
173 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  42.42 
 
 
173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  40.37 
 
 
173 aa  127  6e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  42.95 
 
 
159 aa  125  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  43.71 
 
 
160 aa  124  7e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  39.51 
 
 
167 aa  120  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  42.28 
 
 
165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  37.57 
 
 
181 aa  117  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  42.18 
 
 
169 aa  117  9e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  38.99 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  38.69 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  38.69 
 
 
173 aa  116  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  41.83 
 
 
172 aa  115  3e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.94 
 
 
168 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  40.94 
 
 
167 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  39.43 
 
 
179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  40.82 
 
 
160 aa  114  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  39.24 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  113  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  39.46 
 
 
154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  42.95 
 
 
171 aa  112  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  40.12 
 
 
173 aa  110  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  39.58 
 
 
159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  40.36 
 
 
169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  39.19 
 
 
172 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  37.66 
 
 
172 aa  107  8.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  39.86 
 
 
171 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  39.6 
 
 
173 aa  105  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  35.76 
 
 
171 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  42.28 
 
 
162 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  39.04 
 
 
166 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  39.04 
 
 
166 aa  104  8e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  40.2 
 
 
106 aa  78.2  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>