57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1489 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  348  2e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  75.33 
 
 		 154 aa  243  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  66.67 
 
 		 167 aa  228  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  59.88 
 
 		 172 aa  213  7e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  64 
 
 		 167 aa  206  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  60.78 
 
 		 171 aa  200  9e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  58.94 
 
 		 159 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  61.18 
 
 		 173 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  61.07 
 
 		 176 aa  195  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  58.28 
 
 		 160 aa  194  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  56.95 
 
 		 169 aa  194  7e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  60.4 
 
 		 173 aa  193  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  56.21 
 
 		 161 aa  192  3e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  56.49 
 
 		 168 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  56.76 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  55.21 
 
 		 165 aa  189  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  55.7 
 
 		 173 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  56.46 
 
 		 160 aa  186  9e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  58 
 
 		 172 aa  186  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  50.62 
 
 		 173 aa  186  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  57.05 
 
 		 162 aa  185  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  54.36 
 
 		 173 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  54.42 
 
 		 159 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  54.97 
 
 		 169 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  56.95 
 
 		 167 aa  181  5.0000000000000004e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  58.28 
 
 		 173 aa  179  2e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  55.63 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  55.63 
 
 		 166 aa  178  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  54.73 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  54.73 
 
 		 173 aa  176  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  58.39 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  56.29 
 
 		 171 aa  171  2.9999999999999996e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  50.34 
 
 		 179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  50 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  51.02 
 
 		 159 aa  157  5e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  52.88 
 
 		 106 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  39.47 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  37.41 
 
 		 177 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  35.76 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  37.09 
 
 		 305 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  36.11 
 
 		 281 aa  104  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  36.73 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  33.76 
 
 		 177 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  36.48 
 
 		 175 aa  100  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  35.76 
 
 		 179 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  36.05 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  33.75 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  35.42 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  35.42 
 
 		 181 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  34.01 
 
 		 181 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  35.37 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  34.44 
 
 		 181 aa  95.1  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  34.69 
 
 		 185 aa  94.4  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  93.6  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  32.65 
 
 		 181 aa  92.4  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  32.7 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  32.7 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>