57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_35950 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  90.79 
 
 
181 aa  283  4e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  90.79 
 
 
185 aa  283  9e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  90.79 
 
 
181 aa  282  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  90.79 
 
 
181 aa  279  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  90.67 
 
 
185 aa  277  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  89.47 
 
 
181 aa  275  2e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  86.75 
 
 
177 aa  264  4e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  85.33 
 
 
179 aa  264  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  86.75 
 
 
177 aa  262  1e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  84.77 
 
 
185 aa  260  4e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  84.77 
 
 
305 aa  260  4e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  84 
 
 
281 aa  254  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  83.44 
 
 
177 aa  255  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  81.33 
 
 
177 aa  251  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  80.79 
 
 
181 aa  251  2.0000000000000002e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  76.97 
 
 
174 aa  244  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  76.97 
 
 
174 aa  244  3e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  76.82 
 
 
181 aa  243  9e-64  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  76.82 
 
 
177 aa  240  5e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  60.54 
 
 
175 aa  176  1e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  45.95 
 
 
176 aa  133  9e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  44.22 
 
 
173 aa  127  6e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  43.62 
 
 
159 aa  122  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  42.28 
 
 
173 aa  121  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  44.3 
 
 
173 aa  121  3e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  42.95 
 
 
160 aa  118  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  40.27 
 
 
173 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  41.61 
 
 
181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  42.18 
 
 
167 aa  115  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  43.62 
 
 
165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  41.61 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  42.36 
 
 
159 aa  112  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  40.94 
 
 
169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  41.22 
 
 
172 aa  111  4.0000000000000004e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  43.62 
 
 
179 aa  110  7.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.14 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  42.86 
 
 
162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  42.28 
 
 
171 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  40.94 
 
 
167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  40.14 
 
 
160 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  44.3 
 
 
162 aa  108  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  38.93 
 
 
154 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  41.61 
 
 
169 aa  106  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  39.46 
 
 
173 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  39.46 
 
 
173 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  39.58 
 
 
167 aa  106  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  39.46 
 
 
172 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  38.93 
 
 
173 aa  103  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  40.4 
 
 
171 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  38.89 
 
 
159 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  39.19 
 
 
173 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  39.73 
 
 
166 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  39.73 
 
 
166 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  35.81 
 
 
172 aa  99.8  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  36.05 
 
 
171 aa  99.4  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  38.46 
 
 
106 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>