57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3907 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  315  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  79.08 
 
 		 167 aa  251  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  75.33 
 
 		 171 aa  243  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  74 
 
 		 173 aa  230  6e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  67.76 
 
 		 159 aa  225  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  71.14 
 
 		 172 aa  224  5.0000000000000005e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  69.54 
 
 		 173 aa  223  8e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  66.89 
 
 		 167 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  70.47 
 
 		 176 aa  217  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  63.82 
 
 		 169 aa  214  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  64.24 
 
 		 173 aa  214  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  64.24 
 
 		 160 aa  211  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  60.78 
 
 		 173 aa  210  7e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  64 
 
 		 168 aa  209  9e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  66.22 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  68.46 
 
 		 172 aa  209  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  62.5 
 
 		 165 aa  208  2e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  66.89 
 
 		 167 aa  207  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  62.25 
 
 		 173 aa  207  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  68.21 
 
 		 171 aa  206  9e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  62.67 
 
 		 173 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  62.67 
 
 		 173 aa  202  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  62.91 
 
 		 162 aa  202  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  61.59 
 
 		 161 aa  201  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  60.81 
 
 		 172 aa  197  3.9999999999999996e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  64.43 
 
 		 173 aa  194  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  58.39 
 
 		 159 aa  193  7e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  64 
 
 		 162 aa  192  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  58.5 
 
 		 160 aa  191  4e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  58.28 
 
 		 169 aa  188  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  57.24 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  57.24 
 
 		 166 aa  187  5.999999999999999e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  55.33 
 
 		 181 aa  174  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  50.99 
 
 		 179 aa  171  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  55.7 
 
 		 159 aa  168  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  55.24 
 
 		 106 aa  134  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  40.94 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  40.94 
 
 		 177 aa  115  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  40.97 
 
 		 281 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  40.27 
 
 		 177 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  39.6 
 
 		 177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  40.82 
 
 		 305 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  43.36 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  39.46 
 
 		 181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  38.89 
 
 		 181 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  38.93 
 
 		 185 aa  108  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  39.58 
 
 		 179 aa  107  5e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  38.93 
 
 		 152 aa  107  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  37.58 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  36.67 
 
 		 177 aa  104  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  37.58 
 
 		 185 aa  104  5e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  37.58 
 
 		 177 aa  103  6e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  37.5 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  35.57 
 
 		 181 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  35.57 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  35.57 
 
 		 174 aa  101  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  35.57 
 
 		 181 aa  100  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>