57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1031 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  100 
 
 
165 aa  337  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  67.79 
 
 
173 aa  221  4.9999999999999996e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  66.88 
 
 
173 aa  219  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  66.88 
 
 
173 aa  219  9e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  64.67 
 
 
168 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  65.13 
 
 
169 aa  214  2.9999999999999998e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  66.67 
 
 
176 aa  213  7e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  64.52 
 
 
167 aa  213  9.999999999999999e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  61.64 
 
 
173 aa  212  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  62.75 
 
 
173 aa  211  3.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  62.5 
 
 
154 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  60.39 
 
 
172 aa  209  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  62.66 
 
 
167 aa  208  2e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  68.12 
 
 
162 aa  207  5e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  60 
 
 
172 aa  206  1e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  61.69 
 
 
160 aa  205  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  63.33 
 
 
172 aa  205  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  57.23 
 
 
173 aa  200  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  60.61 
 
 
171 aa  199  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  60.76 
 
 
173 aa  197  3.9999999999999996e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  59.48 
 
 
162 aa  196  2.0000000000000003e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  60.54 
 
 
167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  61.44 
 
 
159 aa  195  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  57.89 
 
 
159 aa  193  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  53.33 
 
 
166 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  53.33 
 
 
166 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  60 
 
 
160 aa  192  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  58 
 
 
161 aa  190  8e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  55.49 
 
 
173 aa  189  1e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  56.88 
 
 
169 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  55.21 
 
 
171 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  63.58 
 
 
171 aa  188  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  55.03 
 
 
181 aa  177  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  49.08 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  155  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  65.71 
 
 
106 aa  144  6e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  45.45 
 
 
305 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  44.23 
 
 
177 aa  120  9e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  43.59 
 
 
177 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  42.28 
 
 
181 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  42.86 
 
 
281 aa  117  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  42.28 
 
 
181 aa  115  3e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  43.62 
 
 
152 aa  114  5e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  42.95 
 
 
185 aa  114  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  41.67 
 
 
181 aa  114  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  43.06 
 
 
177 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  42.95 
 
 
185 aa  114  6e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  43.75 
 
 
179 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  41.78 
 
 
175 aa  112  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  40.67 
 
 
177 aa  111  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  38.85 
 
 
185 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  39.31 
 
 
174 aa  111  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  40.94 
 
 
177 aa  111  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  39.31 
 
 
174 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  41.67 
 
 
181 aa  110  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  42.36 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  39.51 
 
 
181 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>