57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_3728 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3728  hypothetical protein  100 
 
 
181 aa  360  5.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2603  hypothetical protein  96.23 
 
 
181 aa  313  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.347902  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0689  hypothetical protein  92.68 
 
 
181 aa  308  2e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1291  hypothetical protein  84.57 
 
 
181 aa  280  6.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35950  hypothetical protein  90.79 
 
 
152 aa  280  7.000000000000001e-75  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1987  hypothetical protein  85.71 
 
 
179 aa  279  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2332  hypothetical protein  85.09 
 
 
185 aa  278  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.837155  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31090  hypothetical protein  83.54 
 
 
305 aa  274  6e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000233069  unclonable  1.73393e-22 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2657  hypothetical protein  84.91 
 
 
185 aa  271  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187392 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1257  hypothetical protein  84.18 
 
 
177 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0768491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3522  hypothetical protein  83.44 
 
 
177 aa  269  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2930  hypothetical protein  81.65 
 
 
181 aa  268  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144199  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1881  transposon  81.53 
 
 
177 aa  264  5.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0455  hypothetical protein  78.66 
 
 
185 aa  262  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2718  hypothetical protein  73.86 
 
 
174 aa  258  3e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3021  hypothetical protein  73.86 
 
 
174 aa  258  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1487  hypothetical protein  84 
 
 
281 aa  258  3e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4169  hypothetical protein  76.43 
 
 
181 aa  253  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1266  hypothetical protein  70.62 
 
 
177 aa  251  3e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2623  hypothetical protein  78.21 
 
 
177 aa  250  7e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00370788  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2089  hypothetical protein  61.07 
 
 
175 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0584  hypothetical protein  40.57 
 
 
176 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.500305  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4012  hypothetical protein  42.36 
 
 
173 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3012  hypothetical protein  43.06 
 
 
173 aa  121  4e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1511  hypothetical protein  43.75 
 
 
173 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3348  hypothetical protein  39.61 
 
 
167 aa  117  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.392467  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3079  hypothetical protein  38.26 
 
 
173 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1069  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1743  hypothetical protein  40.4 
 
 
160 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3188  hypothetical protein  40.67 
 
 
161 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.042955  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2249  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  112  3e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1031  hypothetical protein  41.67 
 
 
165 aa  110  8.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0887727  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2870  hypothetical protein  40.97 
 
 
169 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0215665 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3181  hypothetical protein  42.36 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3907  hypothetical protein  38.89 
 
 
154 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3843  hypothetical protein  40.28 
 
 
167 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2494  hypothetical protein  40.28 
 
 
181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.666227  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0757  hypothetical protein  40.14 
 
 
168 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.833285 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3534  hypothetical protein  36.97 
 
 
173 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.496332  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1201  hypothetical protein  36.97 
 
 
173 aa  108  5e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2623  hypothetical protein  39.86 
 
 
172 aa  108  5e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2801  hypothetical protein  39.87 
 
 
172 aa  108  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1606  hypothetical protein  42.36 
 
 
171 aa  107  6e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.334677  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0363  hypothetical protein  41.18 
 
 
179 aa  107  7.000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7434  hypothetical protein  38.61 
 
 
167 aa  107  7.000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.653465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7734  hypothetical protein  38.89 
 
 
160 aa  107  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.792325 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0980  hypothetical protein  43.06 
 
 
162 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.440429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3820  hypothetical protein  40.97 
 
 
173 aa  104  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.419072  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0707  hypothetical protein  40.14 
 
 
169 aa  102  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3557  hypothetical protein  37.5 
 
 
159 aa  101  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3371  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0133  hypothetical protein  38.46 
 
 
166 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.872358  normal  0.685684 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2334  hypothetical protein  35.81 
 
 
172 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.406871  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3684  hypothetical protein  38.89 
 
 
173 aa  100  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0520  hypothetical protein  37.2 
 
 
171 aa  99.4  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.978013  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1489  hypothetical protein  35.1 
 
 
171 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0848  hypothetical protein  39.39 
 
 
106 aa  75.5  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0240566 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>